Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KANK3Q6NY19 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms