Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
REEP3Q6NUK4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
REEP3Q6NUK4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms