Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRHL2Q6ISB3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRHL2Q6ISB3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms