Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPPQ6IPU0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms