Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX8Q68G74 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LHX8Q68G74 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX8Q68G74 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms