Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT79Q5XKE5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT79Q5XKE5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms