Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPATA1Q5VX52 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATA1Q5VX52 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPATA1Q5VX52 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms