Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OBSCNQ5VST9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms