Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRAMEF5Q5TYX0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF5Q5TYX0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms