Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGSNQ5TDP6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGSNQ5TDP6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms