Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC183Q5T5S1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC183Q5T5S1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms