Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2LQ5T4T6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms