Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf220Q5T0J3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms