Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CEP170Q5SW79 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CEP170Q5SW79 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CEP170Q5SW79 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms