Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TFDP3Q5H9I0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms