Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAN3Q58A45 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms