Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRC23Q53EV4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRRC23Q53EV4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC23Q53EV4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC23Q53EV4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC23Q53EV4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC23Q53EV4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LRRC23Q53EV4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms