Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms