Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A52Q3SY17 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A52Q3SY17 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A52Q3SY17 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A52Q3SY17 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A52Q3SY17 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A52Q3SY17 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A52Q3SY17 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A52Q3SY17 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A52Q3SY17 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A52Q3SY17 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A52Q3SY17 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A52Q3SY17 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms