Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD55Q3KP44 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms