Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL40Q2TBA0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL40Q2TBA0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms