Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TYSND1Q2T9J0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms