Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSR1Q2NL82 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms