Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC27Q2M243 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC27Q2M243 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms