Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MICBQ29980 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MICBQ29980 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MICBQ29980 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MICBQ29980 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MICBQ29980 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MICBQ29980 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MICBQ29980 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MICBQ29980 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MICBQ29980 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MICBQ29980 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MICBQ29980 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MICBQ29980 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MICBQ29980 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MICBQ29980 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MICBQ29980 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MICBQ29980 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MICBQ29980 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MICBQ29980 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MICBQ29980 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MICBQ29980 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICBQ29980 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICBQ29980 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICBQ29980 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICBQ29980 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICBQ29980 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICBQ29980 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MICBQ29980 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICBQ29980 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICBQ29980 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MICBQ29980 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICBQ29980 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICBQ29980 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICBQ29980 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICBQ29980 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICBQ29980 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICBQ29980 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICBQ29980 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICBQ29980 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICBQ29980 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICBQ29980 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICBQ29980 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MICBQ29980 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MICBQ29980 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MICBQ29980 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MICBQ29980 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MICBQ29980 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MICBQ29980 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MICBQ29980 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MICBQ29980 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms