Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q1T7F1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q1T7F1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q1T7F1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q1T7F1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q1T7F1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q1T7F1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q1T7F1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q1T7F1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q1T7F1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q1T7F1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q1T7F1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q1T7F1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q1T7F1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms