Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNOP1Q1ED39 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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