Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM1Q16610 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM1Q16610 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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