Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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TNXAQ16473 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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TNXAQ16473 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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TNXAQ16473 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TNXAQ16473 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TNXAQ16473 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNXAQ16473 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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