Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC1Q15915 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC1Q15915 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC1Q15915 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC1Q15915 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC1Q15915 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC1Q15915 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZIC1Q15915 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC1Q15915 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC1Q15915 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC1Q15915 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC1Q15915 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC1Q15915 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC1Q15915 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC1Q15915 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC1Q15915 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZIC1Q15915 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC1Q15915 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZIC1Q15915 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZIC1Q15915 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC1Q15915 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC1Q15915 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC1Q15915 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC1Q15915 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC1Q15915 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZIC1Q15915 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC1Q15915 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZIC1Q15915 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZIC1Q15915 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZIC1Q15915 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC1Q15915 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC1Q15915 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC1Q15915 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC1Q15915 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC1Q15915 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC1Q15915 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC1Q15915 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC1Q15915 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC1Q15915 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZIC1Q15915 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC1Q15915 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC1Q15915 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC1Q15915 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC1Q15915 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC1Q15915 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms