Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITSN1Q15811 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITSN1Q15811 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITSN1Q15811 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITSN1Q15811 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITSN1Q15811 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITSN1Q15811 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITSN1Q15811 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITSN1Q15811 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITSN1Q15811 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITSN1Q15811 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITSN1Q15811 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
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