Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRADDQ15628 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRADDQ15628 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms