Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP1Q15431 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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