Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A2Q15428 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms