Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1I3Q14994 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
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