Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCARF1Q14162 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms