Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE1CQ14123 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE1CQ14123 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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