Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CNGB1Q14028 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNGB1Q14028 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
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