Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PDE6HQ13956 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PDE6HQ13956 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PDE6HQ13956 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PDE6HQ13956 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE6HQ13956 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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