Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1CQ13936 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1CQ13936 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms