Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP1Q13829 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
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