Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA9Q13797 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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