Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4BQ13620 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4BQ13620 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.4 ms