Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms