Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3FQ13275 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA3FQ13275 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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