Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
GRIN2BQ13224 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
GRIN2BQ13224 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GRIN2BQ13224 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
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