Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERCC8Q13216 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERCC8Q13216 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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