Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
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