Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP1Q12981 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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