Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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